9. stíhací-bombardovací peruť byla vytvořena 20. listopadu 1940 jako 9. stíhací peruť (přepadová). Aktivována byla 15. ledna 1941 na Selfridge Field v Michiganu a společně se 7. a 8. stíhací perutí přidělena k 49. stíhací skupině. Pro výcvik dostala PT-17, PT-13, P-35 a P-40C.

Koncem května 1941 byla přesunuta na Morrison Field na Floridě k přeškolení na P-40. Po vstupu USA do války byl výcvik urychlen a začátkem ledna 1942 peruť odjela do Austrálie. Dne 2. února dorazila do Melbourne a o dva týdny později na Williamtown Airfield severně od Newcastle.

Po krátkém výcviku byla s P-40 nasazena k protivzdušné obraně Severního teritoria. Dne 17. března se přesunula do Darwinu a následující den provedla první bojovou misi. Dne 15. května byla přeznačena na 9. stíhací peruť 49. stíhací skupiny. Za intenzivní boje od 18. března do 25. srpna získala Distinguished Unit Citation (DUC).

Dne 10. října 1942 se přesunula do Port Moresby na Nové Guineji. Bránila základnu, doprovázela bombardéry a transportní letouny a útočila na nepřátelská zařízení, zásobovací trasy a soustředění vojsk. Na Nové Guineji zůstala po celý rok 1943, účastnila se ofenzivy na Buna Trail, bitvy v Bismarckově moři a bojů o Huonský záliv. Za toto období získala další dvě DUC.

Na podzim 1943 vyměnila P-40 za P-38, kvůli nedostatku letounů však v listopadu dočasně přešla na P-47. V květnu 1944 se vrátila k P-38.

V roce 1944 kryla vylodění na Noemfooru a podílela se na dobytí Biaku. Koncem června se přesunula na Biak a létala dálkové doprovodné a útočné mise nad Mindanao, Halmaheru, Ceram a Borneo. Dne 24. října se přesunula na Leyte, odkud bojovala s nepřátelskými stíhači, napadala lodě v Ormockém zálivu, podporovala pozemní síly a kryla invazi na Luzon. Za akce nad Filipínami od 27. října do 7. prosince získala čtvrtou DUC.

V závěru války útočila z Filipín na průmyslové a dopravní cíle na Formose a lodní dopravu u čínského pobřeží. Dne 16. srpna 1945 se přesunula na Okinawu v rámci příprav plánované invaze do Japonska.

Do konce války zničila 49. stíhací skupina 678 nepřátelských letounů, nejvíce ze všech amerických stíhacích skupin v Pacifiku. Mezi 43 esy skupiny patřili i dva nejúspěšnější američtí stíhací piloti Richard Bong se 40 a Thomas McGuire s 38 vítězstvími; oba létali u 9. perutě.

Po japonské kapitulaci se peruť v září 1945 přesunula na Atsugi u Tokia. V únoru 1946 odešla do Chitose a P-38 nahradily P-51. Zajišťovala protivzdušnou obranu Honšú a Hokkaida. V dubnu 1948 se přesunula na Misawa Air Base a začala přebírat proudové F-80. Dne 1. února 1950 byla přeznačena na 9. stíhací-bombardovací peruť 49. stíhací-bombardovací skupiny.

Když 25. června 1950 vypukla korejská válka, byla peruť dočasně na Komaki Air Base. Okamžitě byla uvedena do patnáctiminutové pohotovosti a 27. června přidělena k 8. FBG. Téhož dne se přesunula do Itazuke a zahájila bojovou činnost; do konce dne provedla 24 vzletů v šesti bojových misích. Dne 29. června dosáhla prvních vítězství války. Nadporučík William Norris sestřelil severokorejský La-7, nárok však nebyl individuálně přiznán, protože letoun před pádem zasáhlo více pilotů.

V prvních týdnech podporovala pozemní síly OSN útoky na dělostřelecká postavení, soustředění vojsk a další cíle. Dne 14. srpna si vyměnila úlohu se 7. FBS a vrátila se do Misawy k odpočinku. Do boje se vrátila 4. září.

Kvůli omezenému doletu F-80 byla koncem září 1950 přesunuta do Taegu, kde zůstala do července 1951. Na podzim 1950 a na jaře 1951 doprovázela B-29 nad Severní Koreou a střetávala se s MiGy-15. Po čínském vstupu do války se znovu zaměřila na podporu pozemních sil.

Koncem července 1951 byla stažena z boje k přeškolení na F-84. Bojovou činnost z Taegu obnovila 15. září. O dva dny později ztratila první F-84, když podporučík John Ward nouzově přistál na letišti.

Peruť se nyní zaměřovala především na přerušování silniční a železniční dopravy mezi Pchjongjangem a Sinuiju, ale létala také přímou podporu pozemních sil. Mezi významné cíle patřily hydroelektrárny Sui-ho v červnu 1952 a politická škola Kumgang v říjnu.

V polovině prosince 1952 byla 9. FBS stažena z bojových operací a přesunuta na Komaki Air Base, kde byla 17. prosince přidělena k protivzdušné obraně Japonska. Dostala F-84G a zahájila výcvik v použití speciálních zbraní pro případný jaderný úder. Zůstala v pohotovosti pro případ dalšího nasazení v Koreji, k němuž už nedošlo.

Za činnost v korejské válce získala dvě DUC, za období 27. června až 25. listopadu 1950 a 9. července až 27. listopadu 1951. Dvakrát obdržela také Presidential Unit Citation Korejské republiky.

Po skončení války zůstala několik let na Komaki. Koncem roku 1957 bylo v rámci rozpočtových škrtů rozhodnuto deaktivovat 49. stíhací-bombardovací křídlo v Japonsku. Dne 10. prosince 1957 byla 9. peruť administrativně přesunuta do Etain/Rouvres ve Francii, kde převzala letouny, personál a vybavení 563. FBS vyzbrojené F-100.
